（一）一般检查

1.血常规：白细胞计数多正常，部分患者可见淋巴细胞和血小板轻度减少，新生儿感染血小板减少较常见。

2.生化检查：部分患者血清丙氨酸氨基转移酶（ALT）、天门冬氨酸氨基转移酶（AST）、肌酸激酶（CK）可升高。

3.脑脊液检查：并发脑膜脑炎时脑脊液检查符合病毒性脑炎改变。

（二）病原学和血清学检查

1.核酸检测：采用实时荧光PCR或等温扩增核酸检测等方法检测血液样本中的基孔肯雅病毒核酸。

2.病毒分离：采用Vero、C6/36、BHK-21和HeLa等敏感细胞进行病毒分离。

3.血清抗体检测：采用ELISA、免疫层析等方法检测血清特异性IgM和IgG抗体。IgM抗体于发病3～4天可检出，5天后阳性率增高，可持续数周至数月，因IgM抗体在潜伏期和发病早期阳性率低，阴性不能排除感染。IgG抗体于发病后第5～8天可检出，可持续数年。

（三）影像学检查

可见关节滑膜炎、关节肿胀、关节腔积液、腱鞘炎等改变

主要与以发热、关节痛或皮疹为主要临床表现的相关疾病鉴别，关节疼痛和僵硬持续时间长者要与其他慢性关节炎鉴别。

（一）登革热

登革热与基孔肯雅热的传播媒介相同，流行区域基本相同，临床表现类似，较难鉴别，且可存在合并感染的情况。登革热发热多为中高热，持续时间更长，肌肉痛、腹部症状（腹痛、腹胀、便秘等）更明显，有出血倾向，外周血白细胞和血小板减少明显，红细胞压积、ALT或AST常增高，重症较基孔肯雅热多见，可出现休克、脑病、多器官功能障碍等并发症。而基孔肯雅热多为中低热，关节疼痛明显，可为首发症状，多累及远端小关节，外周血白细胞、血小板基本正常，重症少见。需核酸检测鉴别。在登革热流行高风险区，建议也对登革热进行检测。

（二）寨卡病毒病

寨卡病毒病与基孔肯雅热的传播媒介相同，流行区域基本相同，临床表现类似，亦表现为中低热，可伴皮疹、头痛、关节痛、肌痛和结膜炎，孕妇感染可引起胎儿小头畸形。基孔肯雅热关节痛更明显。需核酸检测鉴别。

（三）传染性红斑

由细小病毒B19感染引起。儿童感染可表现为持续中高热，常合并皮疹，皮疹为多形性、多部位分布，典型表现为面颊部红斑样皮疹伴有口周苍白圈，称之为“掌击脸”，也可出现受累关节部位红斑、关节痛，常见外周血红细胞下降。核酸及病毒抗体检测有助于鉴别诊断。

（四）其他

本病还需与疟疾、其他甲病毒感染、流感、麻疹、风疹、传染性单核细胞增多症、风湿热、反应性关节炎、类风湿关节炎、系统性红斑狼疮等疾病相鉴别。

目前我国尚无可供使用的基孔肯雅病毒疫苗。预防主要措施包括及时清除蚊虫孳生地，降低蚊媒密度；个人应使用蚊香、驱避剂、蚊帐等方式驱蚊、灭蚊和防蚊；前往基孔肯雅热流行区的旅行者要提高防范意识，防止在境外感染基孔肯雅热。